Ninjan studerade länge och äntligen är det dags att använda sina kunskaper och färdigheter i Dark Ninja Hanjo. Sensei informerade sin student om att han var redo att börja ett självständigt liv, men samtidigt ombads den tidigare studenten att utföra ett mycket viktigt uppdrag för att återställa staden. Uppdraget kommer att visa hur förberedd hjälten är. Staden förtärs av mörker för att befria den, du måste bekämpa demoner eller besatta krigare. Ninjan kommer att kunna visa vad han kan. Ta emot instruktioner från läraren i det inledande skedet, han kommer att följa med sin elev, men då måste du agera på egen hand i Dark Ninja Hanjo.