I början av Battle Monsters-spelet hittar du en liten karaktär som väntar vid mållinjen på ett enormt monster som Godzilla. Det är ingen idé att slåss mot honom som han är, jätten kommer att krossa din hjälte med ett lillfinger. Därför måste du få styrka, mutera och bli ett minst lika stort monster, eller ännu bättre, ännu större. För att göra detta måste du samla gröna element och under inga omständigheter ta vita och röda kapslar. Undvik hinder, och om det är omöjligt att göra detta, bryt dem. Vid mållinjen klickar du på din hjälte så att han hamrar på monstret tills det flyger långt fram. Och du kommer att flytta till en ny nivå i Battle Monsters.