Hjältinnan i spelet Free Fly, ett bi, föddes nyligen och skickades omedelbart ut ur kupan för att samla pollen och nektar, eftersom detta är hennes jobb. Biet hjälper gärna sin familj. Hon vill göra lite nytta och åkte inte dit alla bin hade flugit, utan till andra sidan i hopp om att hitta fler blommor där. Istället kan hon hamna i problem om du inte hjälper henne. Du måste sträva uppåt hela tiden, samla honungskakor med honung längs vägen. Samtidigt måste du skickligt undvika kollisioner med solar, blommor och moln. De verkar lätta och viktlösa, och en kollision med dem kommer att få biet att störta ner i Free Fly.