Ofta återspeglas händelser från det förflutna i nuet och detta händer eftersom händelsen inte fick sin logiska slutsats eller kräver hämnd. Detta är vad som hände i Samurai Rurouni Wars med en samuraj i anden, men en vagabond i grunden. Han reser världen runt och slåss mot skurkar. Förr i tiden blev hans far förrådd av dem han aldrig trodde var möjliga och detta förvandlade samurajen till vad han blev - en ronin. Han vill inte tjäna en mästare, hans lott är ensamhet och den eviga kampen mot ondskan. Du kommer att hjälpa hjälten att flytta från domän till domän för att utrota den onda skepnaden av grymma samurajer som har tagit till den mörka sidan i Samurai Rurouni Wars.