Ett märkligt neonregn föll över staden i Neon Rain. Detta fenomen inträffade sent på natten och de flesta stadsborna märkte ingenting. Men konsekvenserna började visa sig lite senare. På gatorna i mörka gränder där det inte finns någon belysning dök märkliga lysande mänskliga silhuetter upp. Liknar spöken. Till en början skrämde de ensamma förbipasserande på natten, men sedan började de bete sig aggressivt och fall av mord orsakade av en neonman blev vanligare i olika delar av staden. En legosoldat skickades för att ta itu med dessa konstiga och nu farliga varelser. Vid den tiden hade neonfolket också beväpnat sig, så striden kommer att vara nästan lika i Neon Rain.