I skydd av mörkret går en modig ninja på jakt och du måste hjälpa honom att klara sitt jobb i Night Ninja. Och det består av att rensa territoriet från banditer som också anser sig vara ninjor och därigenom förringar ädla krigare. Rånare fiskar på natten, så vår hjälte tvingas också att agera på natten. I det övre högra hörnet ser du uppgiften för varje nivå. Det ligger i antalet förstörda fiender. För att eliminera måste du använda en shuriken, kasta den på avstånd och ett katanasvärd för närstrid. Alla nödvändiga knappar finns i det nedre högra hörnet i Night Ninja.