När ett virus angriper försöker organismer klara av det på egen hand, men det finns inte alltid tillräckligt många, så man måste hjälpa till med olika läkemedel eller vacciner. I Kill the Virus-spelet kommer du att befinna dig i processen och hjälpa den grå cellen att bekämpa attackerna från många röda virus. De kommer att attackera från alla håll, och du kommer att trycka på den grå cellen så att den skjuter tillbaka. Varje miss stärker viruset, det blir starkare och svårare att förstöra. Din cell har tio liv, ta hand om dem, när de tar slut kommer cellen att drabbas av ett virus i Kill the Virus.