En morgon vaknade Mario av att något hindrade honom från att ligga på rygg. När han hittade några utväxter blev han ganska rädd och kom omedelbart till besinning av rädsla och sprang till spegeln för att titta. Vad som dök upp bakom det. När hjälten såg de små vingarna blev han förvånad och till och med först upprörd i Flappy Mario. Men sedan, vid närmare eftertanke, bestämde han sig för att förmågan att flyga skulle ge honom många fördelar. Han behöver inte längre ta hand om transporten, han kan ta sig över vägen genom luften mycket snabbare än på en motorcykel eller bil. Det återstår bara att lära sig flyga och du kommer att hjälpa honom med detta genom att gå in i Flappy Mario-spelet.