Svampriket har genomgått en främmande invasion. Främmande robotar går längs plattformarna och gatorna och hotar alla invånare med sina järnklor. Mario är den enda som kan motstå aggressorn, han har redan ätit svamp, har blivit en stor Super Mario, beväpnad med en hammare och stenar och är redo att slåss. Hjälp hjälten, han kommer att röra sig tillräckligt snabbt, och du, genom att klicka på de valda knapparna i nedre högra hörnet, får honom att antingen kasta sten eller slå fienden med en hammare. Det är bättre att kasta sten på större robotar. Och för små räcker det med ett hårt slag mot huvudet i Super Mario Run.