Ben 10 är inte främling för ankomsten av ytterligare ett antal utlänningar som vill förtala jordgubbar. Men den här gången i Ben 10 Omnitrix Shadow blev saker mycket allvarligare. Utlänningarna leddes av en riddare i svart rustning, han lanserade en ström av energi in i Ben, smittade killen med mörk energi. Sedan lämnade inkräktarna snabbt. Ett mörkt virus har bosatt sig i hjälten, som med tiden kommer att förvandla honom till ett ondt monster, liksom alla som är i omnitrixen. För att fixa situationen och bli av med viruset måste du hitta de tre skurkarna och förstöra dem. Hjälp karaktären att bli sig själv igen och förhindra omvandlingen.
