Spelets hjälte Subway Runner 3D missade det sista tåget på tunnelbanan och bestämde sig för att gå hem till fots, men längs tunnelbanan, utan att gå till ytan. En polisman i tjänst lade märke till honom och vill stoppa honom, eftersom det är strängt förbjudet att gå på tunnelbanan även efter att tågen inte längre går. Men detta stoppade inte vår hjälte; han rusade upp och sprang för att bli av med polismannens jakt. Hjälp honom att undvika hinder, hoppa över eller krypa under dem. Samla mynt och löpning kommer att bli lönsamt för hjälten i Subway Runner 3D.
