Livet i svampriket störs återigen av kidnappningen av prinsessan Peach. Bowser kan inte lugna ner sig och kan inte komma på något nytt förutom att kidnappa prinsessan. Mario i Super Mario Flash kommer att åka på en resa för att rädda en tjej, detta är inte första gången för honom, och du har en anledning att återigen bli en deltagare i ett roligt äventyr. Guide Mario över plattformarna och hoppa på onda svampar och sköldpaddor. Hitta den stora magiska flugsvampen som kommer att förvandla rörmokaren till Super Mario. Dessutom kan du hitta en magisk blomma på plattformarna, som också kommer att stärka hjälten och ge honom styrka i Super Mario Flash.
