Grodan bodde i hans träsk och hade inga bekymmer. Dagar gick efter dagar, hon fångade myggor, hoppade på kojor, vilade på ett stort näckrosblad och var bara rädd för att möta storkar. Men en dag i Frogy Ninja 2D stördes grodans lugna liv. Ninjaiglar dök upp i deras inhemska träsk. De är ovanliga och stora i storlek. Maskar attackerar inte, de ockuperar helt enkelt territorier och invånarna måste lämna sina hem. Men grodan tänker inte hålla ut. Hon satte också på sig ett ninjapannband, så hjälper du hjältinnan att accelerera och slå ner blodiglarna från de platser där de fastnat. Observera att när en groda accelererar kan den inte stanna; bara en vägg eller ett block kommer att stoppa den. Guldblock är väldigt hala och omöjliga att ta tag i i Frogy Ninja 2D.