Det verkar inte finnas något sådant som gravitation för ninjorna i Flip Ninja. Han kan hoppa upp och sedan falla ner med samma smidighet, alltid stå stadigt på båda fötterna. Att hoppa i sig är därför inget problem för honom, men det som finns i rymden kommer att bli ett test. Vassa shurikens och andra genomträngande och skärande föremål flyger ut från vänster och höger. Du måste välja ett ögonblick när vägen är fri och först då hoppa. För varje lyckat hopp får du en poäng, och om du lyckas ta en frukt: röd eller grön får du tre poäng på en gång i Flip Ninja.