Utomjordingens skepp kraschade någonstans i öknen på den avlägsna och obekanta planeten Jorden. Utomjordingen planerade inte att landa på vår planet, men hans skepp tappade kontrollen från en kollision med en meteorit och kraschade. Piloten lyckades överleva, men hans fall gick inte obemärkt förbi. Radarer och satelliter upptäckte ett okänt föremål och helikoptrar flög omedelbart till haveriplatsen. Utomjordingen behöver fly, han vill inte bli ett objekt för experiment. Hjälp honom att springa snabbt och skickligt hoppa över kaktusar och andra hinder och samla mynt. Då och då kommer du att fångas upp av en helikopter och beskjutas med missiler i Alien Runner.
