Frukterna i Fruit Ninja är inte tänkta att ätas som sallader eller bara för skojs skull. Ett gäng frukter samlades in av hjälten i ninjaspelet, för att inte förlora sina färdigheter med ett katanasvärd. Hjälten arbetar som kock på ett kafé, för några år sedan lämnade han sitt hemland inte av egen fri vilja, utan gömde sig från den lokala maffian. Men maffians händer är långa och de kan hitta honom när som helst, vilket innebär att du måste vara förberedd och utbildning krävs. Och eftersom det inte finns någon speciell sportutrustning till hands, måste du använda frukt. Assistenten kommer att slänga vattenmeloner, bananer, äpplen, kiwi och andra frukter, och du kommer att skära dem i Fruit Ninja.
