Ninja är hjälten i många spel, och i Carrot Ninja ser han mycket ut som en vanlig morot. Så är det - det här är en morotsninja och han tänker ta sig till nästa pagod på varje nivå. Detta är syftet med hjälten. Hjälp honom att skickligt hoppa på plattformarna, samla mynt om möjligt. Längre ut på nivåerna kommer det att finnas ytterligare hinder i form av robotiga igelkottar och andra problem som måste hoppa över. I det övre högra hörnet hittar du antalet morotsliv i form av gröna blad. Så fort du använder dem måste nivån startas om i Carrot Ninja.
