Mystiska undersökningar leder alltid till sammandrabbningar med andra världsliga krafter och oftast är dessa onda spöken. Shaggy och Scooby var aldrig kända för sitt mod och föredrog oftast att fly när de kände fara. Den här gången i spelet Scooby Shaggy Run ändrade inte vännerna sin vana. Paret kommer att rusa genom slottets salar, förföljda av ett stort grönt spöke. Slottet är gammalt, olika föremål ligger på golvet, genom vilka du måste ha tid att hoppa över, annars kommer spöket ikapp, det trampar redan bokstavligen i hjältarnas hälar. Var uppmärksam och reagera snabbt på nästa hinder för att ge kommandot att hoppa in i Scooby Shaggy Run.
