Hjältinnan i Water Runner älskar sina blommor väldigt mycket. Men de planteras på en plats där det råder en katastrofal brist på vatten. Från detta växer nästan inte blommor. Några groddar sträckte ut sig och tillväxten avstannade. Vatten behövs akut och du måste hjälpa värdinnan att samla alla flaskor med blå vätska. Eftersom hon inte kan göra det ensam, kommer hennes vänner att hjälpa henne. Efter att ha gått en viss sträcka och fyllt burken som hänger bakom hennes rygg kommer hjältinnan att tömma den i en stor tank så att hennes vän kan klättra på korken och fortsätta loppet efter vatten. Vid målgången kommer vattnet att sitta på blommorna och de växer snabbt i Water Runner.