En modig ninja vid namn Kyoto måste klättra upp på taket på en hög byggnad. Du i spelet Ninja Up kommer att hjälpa karaktären i detta äventyr. Framför dig kommer din ninja som står på marken att synas på skärmen. På en signal kommer din karaktär att börja hoppa till en viss höjd. Du måste rita en linje under ninjan med musen. Så fort du ritar det kommer ett speciellt gummirep att dyka upp. Din hjälte, efter att ha fallit på den, kommer att hoppa och flyga upp. Så genom att dra dessa rep i spelet Ninja Up kommer du gradvis att hjälpa hjälten att klättra upp på byggnadens tak. Samtidigt måste du på vägen hjälpa ninjan att samla föremål som kommer att hänga i luften på olika platser på spelplanen. För deras val i spelet Ninja Up kommer att ge dig poäng.
