Två bröder på resande fot hittade ingången till en mystisk grotta. De bestämde sig för att utforska den, men misstänkte inte att det var en portal till en annan värld och den visade sig vara öppen. Hjältarna visade sig på ett ögonblick vara väldigt långt från sitt hem och det är inte längre möjligt att återvända tillbaka på samma sätt. Portalen har stängt, du måste leta efter andra utgångar och du kommer att hjälpa hjältarna i deras sökande i Super Brothers-spelet. På varje nivå är det nödvändigt att samla sexsidiga kristaller och nycklar utan att misslyckas. Utan dem kommer stendörrarna inte att öppnas. Varje bror har sina egna förmågor. Man kan lätt passera vattenhinder, och den andra - eld. Hjältarna måste hjälpa varandra att framgångsrikt undvika fällor och samla nycklar i Super Brothers.