Den äldre ninjamästaren Kyoto bestämde sig för att ge sig själv en färdighetsträning. Du i spelet Fruit Ninja kommer att gå med honom i detta. Ett rum där din karaktär kommer att dyka upp på skärmen framför dig. På en signal kommer frukter att börja flyga ut från olika håll. De kommer att leka på olika höjder och flyga i olika hastigheter. Din uppgift är att skära alla dessa frukter i bitar. För att göra detta, titta noga på skärmen. Så fort frukterna dyker upp är det bara att börja flytta musen över dem. Således kommer du att skära frukten i bitar och få poäng för den. Men var försiktig. Bomber kanske lurar bland frukterna. Om du rör dem kommer en explosion att inträffa och du kommer att förlora nivån. Sedan måste du börja om genomgången av Fruit Ninja-spelet.