Det har blivit en bra tradition för superhjältar från Marvel -universum att gå ensamma ut mot en armé av monster. I Batman Commander hjälper du Batman att slå tillbaka attackerna från monster från rymden. Mycket obehagliga varelser, som liknar fantastiska goblins, kommer att attackera både från luften och från marken. För att inte bli ett lätt mål kommer hjälten att vara i rörelse hela tiden, det vill säga springa. På flykt måste du skjuta på fiender som rör sig mot eller attackerar uppifrån. Färdighet och skicklighet krävs av dig. Uppgiften är att få maximalt antal poäng. Hjälten har tre liv, deras antal återspeglas i det övre vänstra hörnet. När man möter en fiende försvinner ett liv i Batman Commander.