Under en tid levde ninjariket lugnt och utvecklades, nya städer byggdes, befolkningen ökade och sedan började alarmerande signaler komma från utkanten. Människor började återigen märka påverkan av mörka krafter från de gamla fängelsehålorna. Så den fyrkantiga ninjakungen måste gå ner i katakomberna igen och rensa dem i spelet Kingdom of Ninja 4. Du och han kommer att hitta dig själv vid ingången till labyrinten och hjälper honom att klara nivåerna efter varandra. Du måste gå från den röda flaggan till dörren, men för att göra detta måste du använda maximal skicklighet, eftersom det finns många fällor framför dig. Dessa kommer att vara roterande sågar, vassa spikar, kanoner som skjuter kanonkulor från väggarna och många andra. Du måste skickligt manövrera mellan dem, hoppa över och röra dig mot målet. Monster kommer mot dig, men försök inte döda dem, eftersom din hjälte är obeväpnad är det bättre att helt enkelt kringgå dem i spelet Kingdom of Ninja 4 - de kommer inte att förfölja dig. Samla värdefulla kristaller, guldmynt och öppna skattkistor. När du väl når den sista nivån och samlat alla värdesaker, kommer de kvarlämnade monstren att avdunsta och kommer inte längre att orsaka problem för kungarikets invånare.