Ledaren för Power Rangers-teamet har en oavslutad personlig verksamhet som han behöver slutföra och han vill inte ha hjälp från vänner, men han vill gärna använda din i Power Rangers Ninja Run-spelet. Faktum är att hans ninjas bästa vän nyligen försvann. Han gick till en uppgörelse med en av sina fiender, men återvände aldrig. Det har inte kommit några nyheter på en hel vecka, och det låter inte som en krigare som är van att snabbt lösa alla problem. The Red Ranger bestämde sig för att följa i sin väns fotspår och ta reda på hans öde, samt hjälp om det behövs. Hjälp honom i Power Rangers Ninja Run, vägen är lång och mycket farlig. Fällor placeras på plattformarna som exploderar om någon är nära, så var försiktig.