Innan de tar över vår planet skickar de onda utomjordingarna ut små avdelningar av spejdare. Att åtminstone ungefär veta vad man kan förvänta sig. Vanligtvis gör Ben ett utmärkt jobb med dessa små avdelningar, och rymdangriparna har inte bråttom att attackera med all sin kraft, av fruktan för repressalier. Men den här gången är Ben 10: Alien Attack annorlunda. En hel horde flygande tefat flög från en avlägsen galax, som bestämde sig på egen risk och riskerade att förslava jordens invånare. Ben var också tvungen att byta taktik och nu har han en hel kanon till sitt förfogande, och du hjälper honom att skjuta de närmande fartygen i Ben 10: Alien Attack.