Trollkarlsskolan har länge orsakat avund och rädsla för magiska motståndare. Flickor med ovanliga förmågor studerar i magiskolan. I det vanliga livet är det inte lätt för sådana speciella tjejer, människor uppfattar i allmänhet dåligt de som på något sätt skiljer sig från den allmänna massan. I den här skolan kan eleverna känna sig bekväma med samma flickors miljö, och dessutom hjälper mentorer dem att utveckla sina förmågor och lära sig att hantera dem. I spelet Magical Girls måste tjejerna sätta sina färdigheter i arbete, för skolan kommer att attackeras av en armé av robotar. Använd ikonerna längst ner på skärmen för att svepa bort alla fiender.