I det nya Mr Ninja Fighter-spelet går du till det forna Japan och hjälper den modiga ninja-krigskampen mot gäng av rånare. Din karaktär måste åka till avlägsna provinser i landet och förstöra alla gäng av kriminella där. Innan du på skärmen kommer din karaktär beväpnad med ett svärd att vara synlig. Han kommer att springa framåt längs vägen. På hans väg kommer olika fall ned i jorden och fällor. Du måste använda dina kontrolltangenter för att få din karaktär att hoppa över dem alla. När du möter fienden, slå honom med ditt svärd och förstöra fienden.
