Ninja-sköldpaddorna återvände från sin nästa uppgift och fann att deras lärare Splinter saknades. På Manhattan var rastlös, det fanns många mutanter och någon bakom dem. Ett sköldpaddslag hade redan motverkat flera skurkliga planer och den osynliga fienden bestämde sig för att hämnas grymt genom att kidnappa sin sensei. Välj tecknet som först går till striden med mutanterna. Leonardo är mästaren av katanfights, ledaren för laget Raphael hanterar skickligt Sayes, Donethello använder en speciell personal, och Michelangelo föredrar nunchuck. De kommer att hjälpa till i april, hon äger en mästare en grön baseball magisk fladdermus.
