Skogen är en plats dit folk går för att plocka svamp, bär, jaga, köpa ved osv. Närliggande byar lever av skogen och om denna inkomstkälla försvinner lider människor. Det var precis vad som hände i 99 Nights In The Forest- Battle Squads. Okända men onda monster har dykt upp i skogen och människor kan inte gå in i skogen på grund av faran att bli uppätna. Jägarna bestämde sig för att samla en grupp för att slåss och förstöra monstren eller driva ut dem. Hjälp till att bilda en trupp och hjälp dem att besegra monstren. När striden fortskrider, välj olika element: vapen, skyddsammunition och så vidare i 99 Nights In The Forest- Battle Squads.
