När du placerar de stora flerfärgade kuberna i Mega Cube 4096 måste du i slutändan få en megakub med ett numeriskt värde på 4096. För att slutföra uppgiften, kasta kuber med siffror på ett litet spelplan med en avlång form. Oroa dig inte för det faktum att kuber kan falla ut ur fältet, detta kommer inte att hända. Under kollisionen av två block med samma antal kommer det att finnas en liten explosion och istället för två kommer det att finnas ett block med ett nummer multiplicerat med två. Om fältet är igensatt med block, och du inte hade tid att få ett megablock, kommer spelet Mega Cube 4096 att vara klar, men inte vann.