En pirathuggare vid namn Karl var känd för sin grymhet och list över hela Medelhavet, det verkade som om ingen kunde överlista honom. Till och med hans besättning hade länge velat kasta honom från kaptenens brygga, men de kunde fortfarande inte. Karl slog ned kravallerna i tid och straffade rebellerna hårt. Allt kommer dock till ett slut och i Pirate Cutthroat Carl Escape fann sig piraten instängd. De lyckades ändå lura honom och låsa in honom i en hydda på en öde ö. Fartyget och dess besättning seglade snabbt iväg i okänd riktning och den tidigare kaptenen lämnades ensam. Han måste börja om från början, men först måste han komma ut ur kojan i Pirate Cutthroat Carl Escape.