Spelets hjälte A Hollow Heartbeat Escape fick chansen att somna i sin mysiga säng och vakna upp i en gammal, vindpinad hydda. Han öppnade ögonen och insåg direkt att han inte var hemma. Hur en sådan mystisk rörelse gick till återstår att ta reda på, men för nu måste vi komma ut. Insidan av kojan är nästan tom förutom ett bord, en säng och ett par hyllor. Bortom tröskeln till den öppna dörren upptäckte hjälten att hyddan låg på en ö och detta förvärrade hans situation. Men det finns ingen anledning att misströsta. Samla allt som kan vara användbart och hitta en lösning på problemet i A Hollow Heartbeat Escape. Det kommer ett konstant ljud från någonstans som låter som ett hjärtslag och det är lite läskigt.