Det finns övergivna städer och detta är ett välkänt faktum, men du skulle aldrig kunna föreställa dig att du skulle befinna dig i en av dem i Mystery Town Escape. Dagen innan bestämde du dig för att besöka din familj, hoppade in i bilen och åkte ut på vägen. Vägen var bekant och tog vanligtvis inte mer än fyra timmar. Men efter att ha kört halvvägs stötte man plötsligt på reparationsarbeten och vägskyltar angav en omväg längs en grusväg, som kunde sträcka sig flera kilometer. Halva vägen har passerats, du vill inte gå tillbaka, så du gick vidare. Vägen visade sig vara obekant och alltmer olycksbådande, och snart dök en stad upp vid horisonten. Du bestämmer dig för att stanna, få något att äta och tanka. Men staden visade sig vara helt tom och förfallen. Var man kan få tag på bränsle och mat är ett problem i Mystery Town Escape.