Den roliga Pokemon Pikachu kommer att bli huvudpersonen i Pokemon Clickers-spelet. Genom att intensivt klicka på det gulliga gula ansiktet stimulerar du utseendet på pokeballs och ackumuleringen av poäng. När du har samlat in det minsta belopp som räcker för att köpa något, gå till butikerna. Du kan köpa nya typer av Pokeballs som gör att du kan samla pengar snabbare eller byta Pikachu till en annan Pokemon. Först måste du arbeta med fingret, trycka på vänster musknapp, och sedan kommer den här funktionen att utföras av själva Pokemon Clickers-spelet.
