Regeringen har instruerat dig att inrätta ett nytt hemligt laboratorium för studier av utomjordingar och allt relaterat till dem. Du i spelet SCP Laboratory Idle kommer att göra detta. Innan du på skärmen kommer du att se laboratoriets rum. Kontrollpaneler med olika ikoner kommer att finnas till höger. En utomjording kommer att dyka upp i laboratoriet. Du måste börja klicka på den mycket snabbt. Varje klick ger dig ett visst antal poäng. Du kan använda dessa poäng för att köpa vetenskaplig utrustning till laboratoriet, anställa nya medarbetare och köpa olika resurser du behöver för forskning.