I den andra delen av Ant Destroyer 2 måste du återigen bekämpa myrorna som försöker fånga ett visst område. Framför dig på skärmen ser du spelplanen där myror kommer att dyka upp. De kommer att krypa ut från olika sidor och röra sig i olika hastigheter. Din uppgift är inte att låta dem lämna spelplanen. Du måste noggrant överväga allt och bestämma de primära målen. Nu måste du klicka på de myror du väljer med musen. På så sätt kommer du att identifiera dem som mål och träffa myrorna. Varje sådant slag kommer att förstöra myran och du kommer att få poäng för det.
