Under medeltiden utspelade sig hårda strider mellan fartyg mellan många länder på haven. Du i spelet Ships 3D deltar i dessa strider som skeppets kapten. Innan du på skärmen kommer att vara synlig för ditt skepp, som kommer att segla på havet. Baserat på kartan måste du leta efter fiendens fartyg. När du har hittat dem kommer du att konvergera med dem på ett visst avstånd. Efter det, sikta på fiendens fartyg, öppna eld från kanoner. Om ditt sikte är korrekt, kommer dina kärnor att träffa fiendens skepp, orsaka hål i dem och de kommer att sjunka. För varje förstört skepp får du poäng i Ships 3D-spelet. Du kommer också att bli beskjuten. Du måste manövrera ditt skepp för att göra det svårare att träffa.
