En armé av monster har invaderat den magiska skogen och förstört alla byar i dess väg. Du i spelet Nature Strikes Back kommer att befalla försvaret av skogen. En magisk glänta kommer att dyka upp på skärmen framför dig där du kommer att se en liten trädgård. På den kan du odla kampväxter och svampar. Medan de växer måste du noggrant undersöka allt och bestämma strategiskt viktiga platser. I dem måste du placera dina kampväxter och svampar med musen. Så snart monstren dyker upp kommer dina soldater att börja slå dem med magi. Att förstöra monster ger dig poäng. För dem kan du köpa nya frön och odla andra stridsväxter.