Två hemliga agenter Tom och Jack är i en organisation som jagar utomjordingar som har kommit in i vår värld. Idag i Alien Hunter Bros kommer du att hjälpa agenter att göra sitt jobb. Dina hjältar kommer att synas på skärmen framför dig, som kommer att vara på en viss plats. Med hjälp av kontrolltangenterna styr du båda karaktärernas handlingar samtidigt. Titta noga på skärmen. På olika platser kommer du att se främmande monster. Du måste ta med dina hjältar till dem på ett visst avstånd. Sedan, genom att sikta, kommer de att kunna öppna eld med sina vapen. Genom att skjuta korrekt kommer du att förstöra utomjordingarna och få poäng för det. Efter fiendens död kommer dina hjältar att kunna plocka upp troféerna som kommer att falla ur dem.