I den andra delen av Ninja Dogs 2 fortsätter du att hjälpa en grupp ninjahundar att slåss med vakterna från katteriket. Idag måste du attackera deras slott och fånga dem eller förstöra dem. Framför dig på skärmen ser du ett visst område där byggnaderna kommer att ligga. Inuti byggnaderna ser du soldatkatter. En kanon kommer att installeras på ett visst avstånd från byggnaderna. Med dess hjälp kommer du att skjuta dina krigshundar och de, som har flugit ett visst avstånd, kommer att krascha in i byggnadens vägg och förstöra dess angripande katter. För att göra detta måste du beräkna banorna för dina skott. Efter att ha förstört alla katter får du poäng och går till nästa nivå i spelet.
