En armé av monster invaderade kungariket för de små träälvarna. I Fruit Legions: Monsters Siege leder du försvaret av riket. Med hjälp av en speciell verktygslåda måste du odla speciella militära blommor. Efter det måste du undersöka vägen längs vilken armén av monster rör sig. Längs den, på strategiskt viktiga platser, måste du placera dessa blommor. Så snart monstren dyker upp kommer dina blommor att aktiveras och börja skjuta på dem. Genom att förstöra monster får du poäng. Efter att ha samlat en viss mängd av dem kan du odla nya, kraftfullare blommor.