SpongeBob och hans vänner gick för att besöka undervattensriket. Här vill de delta i en schackturnering. I Bikini Bottom Chess hjälper du SpongeBob att vinna det. Ett schackbräde visas på skärmen på spelplanen där det kommer att finnas vita och svarta bitar. De kommer att göras i form av olika havsdjur. Varje bit kan bara röra sig enligt vissa regler. Du kan bekanta dig med dem genom att läsa de speciella instruktionerna i början av spelet. Därefter börjar spelet. Din uppgift är att göra drag och förstöra motståndarens bitar för att försöka sätta hans kung i schackmatta. Om du lyckas kommer du att vinna spelet.