Den modiga ninjaen fick en order från chefen för sin order att tränga in i en aristokrats slott och stjäla dokument där. Du i Ninja Run Up And Down-spelet kommer att hjälpa honom i dessa äventyr. Din karaktär måste springa till slottet längs en väg som passerar genom ett visst område. På vägen kommer han att stöta på olika fällor och monster. Upp till dem måste du tvinga din hjälte att hoppa och flyga genom luften genom alla dessa faror.
