I en avlägsen galax bröt ett krig mellan de två främmande raserna. Du i spelet Clash Of Aliens går med i en av dem och kommer att leda armén. Din flottor kommer in i striden mot fiendens fartygs skvadron. Du kommer att se ditt huvudfartyg framför dig på skärmen. Under det kommer kontrollpanelen. Med det kommer du att skicka dina piloter i strid på deras fartyg. De som attackerar fienden kommer att förstöra dem och för detta kommer de att ge dig poäng.
