Huvudpersonen i spelet Battle Against Time kom in i en tidsportal och transporterades i tid till en avlägsen framtid. För närvarande i världen kämpar människor mot mutanter. Din hjälte kommer att gå med i armén av människor. En viss plats visas på skärmen där din karaktär kommer att ha ett vapen i händerna. Med hjälp av kontrollknapparna får du honom att röra dig i den riktning du vill. Så snart du märker fienden, rikta ditt vapen mot honom och öppna eld för att döda. Om din räckvidd är korrekt, kommer kulorna som träffar fienden att skada honom. Således kommer du att förstöra fienden genom att nollställa hans livsnivå och få poäng för detta.