Vertex Shifter liknar en sokoban, men lite mer komplicerad och svalare. Huvudpersonerna är röda pixelbollar som lever i en mörk underjordisk labyrint. De ber dig att leverera dem till speciell svart triangulär parkering där bollen blir en annan figur. Det finns ett nummer på bollen och det betyder antalet steg en karaktär kan ta. Du måste bana vägen så att dessa steg räcker för att han ska komma till saken. Om triangeln också har ett nummer måste du subtrahera det från antalet bollen, och skillnaden är antalet drag du behöver göra före denna parkeringsplats.