Varje år flyger jultomten på sina magiska rådjur runt om i världen och levererar gåvor. Men problemet är, vår goda farfar lämnades för att besöka en annan liten stad, men hans rådjur var mycket trötta och landade på sidan av berget. Vår hjälte förlorade inte och hoppade på hans fötter och beslutade att springa till staden på sina egna fötter. Du i spelet Pixel Santa Run hjälper honom att komma i tid till den punkt han behöver. Din hjälte kommer att springa så fort han kan på en viss väg. På vägen för dess rörelse kommer olika barriärer att uppstå. Du måste använda dina kontrollpilar för att få din hjälte att springa runt alla dessa farliga delar som finns på vägen.