Idag måste den berömda avdelningen Ji Ai Joe utföra mycket och vi är i game G. I. JOE: Pursuit Of Cobra hjälper dem i detta. I början av spelet måste du välja ditt första uppdrag. Du kan gå norrut eller in i djungeln djungeln. I varje uppdrag måste du hitta basen av terrorister och förstöra den. Runt basen kommer att sätta upp säkerhets squads som du kommer att gå in i strid. Du måste förstöra dem med dina skjutvapen och sprängämnen. Efter att ha dödat fiender samla vapen och ammunition som hjälper dig med uppgiften.